ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with High-Throughput Sequencing）是利用高活性轉座酶Tn5探究染色質可接近性的高通量測序技術。具體來說就是利用轉座酶Tn5來捕獲全基因組范圍內開放性染色質，再通過高通量測序及生物信息學分析來挖掘相關基因和順式調控元件信息，以此探究轉錄調控相關問題。
※ATAC-seq與RNA-seq、CUT&Tag等多組學和多技術聯(lián)合分析，獲取基因表達與上游調控元件、轉錄因子的關聯(lián)信息，解析轉錄因子靶向調控變化機制。
一站式服務：提供樣品處理、ATAC建庫、測序和分析的全套服務。
新鮮或凍存動物組織樣本：≥100mg。
技術流程
實測數(shù)據(jù)
經(jīng)典案例
自然殺傷細胞中全局細胞因子信號網(wǎng)絡的解構：
利用信號轉導因子和轉錄激活蛋白（STAT）的細胞因子信號轉導對于自然殺傷（NK）細胞的最佳抗病毒反應至關重要。采用了ATAC-seq、RNA-seq和ChIP-seq多組學方法解構和重建NK細胞中多種細胞因子信號通路的復雜互作，發(fā)現(xiàn)促炎細胞因子和穩(wěn)態(tài)細胞因子形成協(xié)同軸，共同調節(jié)整體基因表達并進一步抑制由 I 型干擾素信號傳導誘導的表達，這些細胞因子通過STAT蛋白和集體信號介導不同的表觀遺傳調控模式，最佳地概括了全局抗病毒反應。
參考文獻：Wiedemann G M, Santosa E K, Grassmann S, et al. Deconvoluting global cytokine signaling networks in natural killer cells[J]. Nature immunology, 2021, 22(5): 627-638.
